A Polícia Federal investiga a destinação de R$ 119 milhões em emendas indicadas por Valdemar Costa Neto, presidente do PL. Deste total, quase R$ 25 milhões foram direcionados a Porto Seguro, município localizado no Extremo Sul da Bahia, na semana anterior ao prazo limite para o envio de recursos federais antes das eleições municipais de 2024. A legislação proíbe, com algumas exceções, a transferência de recursos da União para estados e municípios nos três meses que antecedem o pleito, que em 2024 ocorrerá no dia 6 de outubro, fazendo com que o prazo se encerrasse em 6 de julho.

Conforme uma reportagem do jornal O Globo, a Bahia foi o segundo estado que mais recebeu repasses entre os investigados. Porto Seguro, sob a gestão do prefeito Jânio Natal, do PL, recebeu R$ 24,9 milhões no mesmo mês em que ele se preparava para disputar a reeleição, a qual conquistou três meses depois. A investigação aponta que as emendas eram formalmente indicadas por Valdemar, que não ocupa cargo de deputado federal, mas registradas em nome de deputados "solicitantes" para dar uma aparência de legalidade ao processo.

Em resposta às irregularidades, o ministro da Justiça, Flávio Dino, determinou o bloqueio de R$ 119,2 milhões em bens de Valdemar Costa Neto e a suspensão da execução de todas as despesas relacionadas às emendas. Em 2025, Valdemar reafirmou sua conexão com as lideranças do PL no Sul da Bahia ao participar de um evento ao lado do pré-candidato ao governo, Antonio Carlos Magalhães (ACM) Neto, e do prefeito Jânio Natal.